A Central de Microscopia Eletrônica, localizada no Bloco IV, da UFPR – Setor Palotina, disponibiliza aos usuários equipamentos em microscopia eletrônica para a caracterização morfológica que possuem resoluções de 0,5 a 3 nm. Outras técnicas acessórias a estes equipamentos se destacam, ampliando a capacidade analítica, tais como: a difração de elétrons, análise química de raios-X, a espectroscopia de emissão por catodo luminescência, estereoscopia em microscopia eletrônica de varredura (MEV) (imagem com perspectiva e informação 3D) e microtomografia de raio-X em MEV.

Além disso conta com raios X por energia dispersiva (EDS), metalizador de amostras e secador de ponto crítico para processamento de amostras biológicas. O laboratório tem caráter multiusuário e atende às demandas cursos de graduação e pós-graduação da UFPR e de outras universidades, além de instituições privadas. O laboratório tem destacado a importância para os projetos desenvolvidos na UFPR – Setor Palotina, especialmente junto aos sete programas de pós-graduação do setor.

Com resolução de 3 nm, o equipamento permite magnificações de até 300 kX. Imagens com pressão controlada entre 3 a 500 Pa. Análise de aspectos tridimensionais por estereoscopia de elétrons secundários. Sistema de análise química tipo EDS (Oxford) com software AZ Tech (Advanced) com detetor tipo SDD de 80 mm².